AFLP技术服务

发布时间 :2022-08-19浏览次数  :2734

AFLP技术服务

AFLP标记技术是1993年由荷兰的Zabeau和Vos博士提出并完善的。现已广泛应用于生物多样性 ,指纹图谱的构建 ,遗传图谱的构建 ,基因克隆等诸多研究领域 ,显示了广阔的应用前景 。AFLP与其他分子标记相比具有 :1        、DNA 用量少;2  、可重复性好;3  、多态性强;4  、分辨率高;5 、样品适用性广 ,6 、对基因组序列信息依赖性低等优点  。在物种的多态性分析中获得广泛的应用  。AFLP的选择扩增产物目前主要通过两种方法进行分离检测 ,传统的聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)的方法和自动化程度较高的毛细管凝胶电泳进行检测 。

PAGE方法主要是AFLP的选择扩增产物经过聚丙烯酰胺凝胶电泳得到分离   ,然后通过银染将条带显现出来,然后通过照相得到相应的图片,优点是引物可以是普通引物 ,价格相对较低  ,做少量样本或者大量样本的引物筛选比较合适,另外还可以对差异条带进行克隆测序  ,获得差异条带的序列信息 。

毛细管电泳检测方法的优点是自动化  ,可以对大量样本进行实验      ,速度快,后期的条带读取可以依靠软件 ,降低了人为读取的标准不一   。

1)AFLP服务内容

1 样本基因组DNA的提取

2 筛选多态性较好的引物(酶切,预扩  ,选择性扩增)

3-1 在ABI3730xl测序仪上完成数据采集

3-2 或是在JY-CX2B型 测序电泳槽上完成PAGE 检测(可以回收差异带)

4 数据分析 :和客户详细沟通,确认分析方案  :读取01矩阵(PAGE胶读取另外收费);聚类分析;多样性分析;多态位点数(AP) 、多态位点百分率( P)  、平均等位基因数(N a)  、有效等位基因数(N e)   、Nei′s基因多样性指数(H)   、Shannon′s信息指数( I)  、遗传分化度(Gst)等。利用NTSYS进行聚类分析。

2)目前已经进行的样本类型  :树木   ,草,花卉 ,昆虫 ,鱼类  ,虾类 ,真菌等;

3)客户提供 :

★ 基因组DNA :

●至少15μL样品,浓度为50-100ng/μL;

●2%琼脂糖电泳检测有DNA主带,没有降解;

●DNA经过DNA纯化试剂盒或磁珠纯化;

●DNA需溶解在TE或灭菌的去离子水里;

●DNA溶解后  ,肉眼看不到杂色;

★ 植物材料 : 新鲜组织 ,叶片采用硅胶干燥后或干冰运输;

★ 动物材料: 新鲜组织,无水乙醇封存低温运输;

4)报价体系 :


AFLP毛细管电泳检测按96个样本随机8对引物计算    ,提供01矩阵
项目单价(元)数量金额备注
DNA提取3096288096个样品
纯化1096960
引物30000FAM标记  ,其他标记350元
酶切40963840
预扩15961440
选择性扩增1076876808对引物
毛细管检测80086400
读带  、分析

议价
合计

23200
AFLP按照50个样本随机8对引物计算,提供PAGE胶图
项目单价数量金额备注
DNA提取3050150050个样品
纯化1050500
酶切40502000
预扩1550750
选择性扩增1040040008对引物
PAGE检测80086400
读带  、分析

议价
合计

15150

AFLP技术服务1

AFLP技术服务2



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